More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2447 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 783 aa  1601    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  75.32 
 
 		 797 aa  1203    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  41.71 
 
 		 797 aa  541  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  39.25 
 
 		 798 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  35.15 
 
 		 761 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 741 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  33.12 
 
 		 755 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 763 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 757 aa  311  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 838 aa  243  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 763 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 780 aa  241  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 777 aa  236  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  29.11 
 
 		 767 aa  234  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 790 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 803 aa  227  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.32 
 
 		 739 aa  227  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 775 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 769 aa  223  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 761 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 783 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 749 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 790 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 778 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 790 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 741 aa  218  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 720 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 835 aa  214  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 862 aa  212  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 771 aa  211  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 769 aa  210  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 903 aa  210  9e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 755 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 919 aa  209  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 864 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 780 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  26.33 
 
 		 839 aa  208  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 732 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 736 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 695 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 733 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 786 aa  205  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 724 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 778 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 710 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 759 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 730 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 751 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 822 aa  200  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 722 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 762 aa  198  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 771 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 803 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 766 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 776 aa  197  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 747 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 779 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 860 aa  196  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 789 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 804 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 726 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 734 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 732 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 784 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.42 
 
 		 754 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 800 aa  190  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 800 aa  190  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  26.44 
 
 		 759 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 862 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 815 aa  187  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 737 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 743 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 763 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 725 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 730 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 825 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 720 aa  183  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 743 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 896 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 796 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 756 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 753 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 738 aa  181  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 713 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 814 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 764 aa  180  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 722 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 808 aa  180  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.03 
 
 		 715 aa  180  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 786 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 817 aa  178  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 853 aa  178  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 779 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 702 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 731 aa  177  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 794 aa  177  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 731 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 809 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 764 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 744 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>