More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0216 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 786 aa  1599    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  65.59 
 
 		 790 aa  959    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  70.91 
 
 		 778 aa  1125    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  71.15 
 
 		 778 aa  1098    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  67.5 
 
 		 803 aa  1073    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  65.68 
 
 		 790 aa  964    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  74.13 
 
 		 767 aa  1143    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  44.96 
 
 		 771 aa  620  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  42.71 
 
 		 800 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  42.71 
 
 		 800 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2637  TonB-dependent receptor  43.25 
 
 		 773 aa  551  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  39.2 
 
 		 756 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  39.73 
 
 		 734 aa  509  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 		 808 aa  412  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 835 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 814 aa  353  8e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 854 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 815 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  32.94 
 
 		 755 aa  319  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 855 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 832 aa  311  4e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 848 aa  308  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 851 aa  306  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 761 aa  303  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 741 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 720 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 873 aa  289  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  31.99 
 
 		 878 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 833 aa  282  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 780 aa  266  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 763 aa  258  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 764 aa  256  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 862 aa  250  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 777 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 732 aa  244  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 769 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 798 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 794 aa  238  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 864 aa  237  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 783 aa  237  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 757 aa  233  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 734 aa  227  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 788 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 747 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 797 aa  223  8e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 736 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 796 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 780 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 838 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 751 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 755 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 755 aa  218  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 763 aa  217  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1846  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 851 aa  215  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 860 aa  216  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 761 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 729 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 783 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 722 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 710 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 903 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  28.53 
 
 		 715 aa  207  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 741 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 799 aa  204  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 722 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 790 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 723 aa  204  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 771 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 728 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  27.05 
 
 		 839 aa  203  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 765 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 815 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 788 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 764 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 773 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 773 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 862 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 713 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 759 aa  198  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.33 
 
 		 739 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 822 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2554  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 861 aa  197  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 797 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 780 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 758 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  32.29 
 
 		 906 aa  197  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 783 aa  196  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 785 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 792 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 771 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 756 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 749 aa  193  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 750 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 787 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 790 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 758 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 730 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 730 aa  191  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 804 aa  190  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 919 aa  190  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>