More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0787 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 788 aa  1592    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 755 aa  288  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 757 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 		 767 aa  230  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 803 aa  225  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 730 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 797 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 778 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 788 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 777 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 778 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 726 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 704 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 769 aa  209  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 749 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.9 
 
 		 755 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 790 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 775 aa  206  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 790 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 761 aa  204  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 824 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 786 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 741 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 814 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 730 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 873 aa  200  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 783 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 720 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 800 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 800 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 777 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 843 aa  191  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 765 aa  190  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 734 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 838 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 724 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 808 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 722 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 737 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 785 aa  187  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 734 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 783 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 780 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 733 aa  183  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 774 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 855 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 835 aa  181  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 769 aa  180  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 723 aa  180  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 743 aa  180  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 790 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 771 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 851 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 759 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 794 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 722 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 822 aa  176  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 783 aa  175  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 798 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 741 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 771 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 751 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 790 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 780 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 732 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 764 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 792 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 729 aa  171  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 731 aa  171  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 848 aa  171  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 763 aa  171  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 761 aa  170  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 758 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 731 aa  169  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 779 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 764 aa  168  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  27.05 
 
 		 856 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 782 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  24.97 
 
 		 776 aa  167  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 736 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 796 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 779 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 761 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 786 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 780 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 746 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 744 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  26.44 
 
 		 747 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 854 aa  165  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 747 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 789 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 728 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 790 aa  164  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 732 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 710 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 794 aa  161  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 761 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 754 aa  160  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 794 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 700 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>