More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1081 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  54.65 
 
 		 856 aa  745    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 734 aa  1493    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  39.97 
 
 		 777 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  34.24 
 
 		 784 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  33.42 
 
 		 822 aa  391  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 752 aa  340  8e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 795 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 753 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 777 aa  301  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 802 aa  293  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 742 aa  267  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 747 aa  267  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 795 aa  266  8.999999999999999e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 792 aa  266  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 807 aa  260  8e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 795 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 808 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 786 aa  251  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 771 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  27.8 
 
 		 785 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 766 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 808 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 712 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 757 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 763 aa  233  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 791 aa  230  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 780 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 780 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 806 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 762 aa  224  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 781 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 875 aa  217  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 904 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 847 aa  210  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 796 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 737 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 751 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 753 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 726 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 802 aa  200  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 724 aa  200  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 798 aa  200  9e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 761 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.19 
 
 		 739 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 732 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 794 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 797 aa  197  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 702 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 747 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 771 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 704 aa  192  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 774 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  28.88 
 
 		 889 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 771 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 720 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 788 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 755 aa  190  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 783 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 723 aa  188  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 763 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 690 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 764 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.98 
 
 		 715 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 710 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 713 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 726 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 769 aa  179  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 690 aa  178  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 736 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 746 aa  177  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 788 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 785 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 738 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.35 
 
 		 755 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 729 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 743 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 766 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 776 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 767 aa  174  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  26.7 
 
 		 801 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 761 aa  174  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 763 aa  174  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 743 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 759 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 734 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 780 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 722 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 790 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 803 aa  173  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 797 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 809 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 735 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  24.38 
 
 		 846 aa  170  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 779 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 759 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 731 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 749 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 797 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 725 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>