More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2226 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 785 aa  1588    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 780 aa  362  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 780 aa  359  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 791 aa  355  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 781 aa  352  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  32.48 
 
 		 889 aa  344  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  33.5 
 
 		 757 aa  326  8.000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 762 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 747 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 802 aa  299  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 763 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 786 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 807 aa  283  9e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 806 aa  277  7e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 771 aa  276  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  30.41 
 
 		 822 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 753 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  32.22 
 
 		 784 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 795 aa  264  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 795 aa  261  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 792 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 734 aa  244  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 742 aa  243  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 712 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 795 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 777 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 766 aa  231  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 798 aa  229  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 808 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 777 aa  223  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  28.01 
 
 		 856 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 752 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 802 aa  212  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 788 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 763 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 904 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 753 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 875 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  26.83 
 
 		 846 aa  194  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 797 aa  193  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 761 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 765 aa  188  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 808 aa  185  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 713 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 700 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 736 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 747 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 751 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 883 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 774 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 792 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 704 aa  174  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 771 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 755 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 886 aa  171  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 720 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 710 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 790 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 830 aa  169  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 724 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 695 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 763 aa  164  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 709 aa  164  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 847 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 771 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 735 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 804 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 731 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 720 aa  160  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 733 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 729 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 734 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 743 aa  159  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 766 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 771 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 755 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 730 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 741 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 775 aa  157  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 797 aa  157  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 690 aa  157  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 731 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 787 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 794 aa  155  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 690 aa  154  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 764 aa  153  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 786 aa  153  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 695 aa  152  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 720 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 745 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 829 aa  151  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 728 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 746 aa  150  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 794 aa  150  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 365 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 779 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 769 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 713 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 723 aa  148  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 784 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>