More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3036 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 904 aa  1869    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 792 aa  452  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  34.73 
 
 		 808 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 875 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 795 aa  395  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  26.94 
 
 		 846 aa  276  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 886 aa  246  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 883 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  26.32 
 
 		 784 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 734 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 786 aa  210  8e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 780 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 753 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 780 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  24.65 
 
 		 785 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 781 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 757 aa  197  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 791 aa  194  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 806 aa  191  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 762 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 802 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  27.29 
 
 		 889 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  24.1 
 
 		 856 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 807 aa  182  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 763 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  24.18 
 
 		 822 aa  177  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 747 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 808 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 802 aa  167  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 742 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 795 aa  161  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 798 aa  159  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 797 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 847 aa  155  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 809 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 766 aa  151  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 788 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 795 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 753 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 712 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 763 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 825 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 729 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 803 aa  139  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 766 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  23.08 
 
 		 767 aa  135  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 743 aa  134  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 809 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 771 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 798 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 804 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 747 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 771 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 786 aa  129  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 774 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 780 aa  127  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  40.21 
 
 		 752 aa  126  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  23.71 
 
 		 741 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 		 737 aa  124  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 722 aa  124  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 790 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 764 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 778 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 790 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 778 aa  121  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  21.01 
 
 		 785 aa  120  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 971 aa  120  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 731 aa  119  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 763 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  22.46 
 
 		 830 aa  119  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 903 aa  118  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  36.28 
 
 		 822 aa  115  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 732 aa  115  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 789 aa  115  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 783 aa  114  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 799 aa  111  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 756 aa  111  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 804 aa  110  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  32.49 
 
 		 801 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 754 aa  110  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 969 aa  110  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 777 aa  109  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 773 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 937 aa  108  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 853 aa  108  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 851 aa  108  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 769 aa  108  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 777 aa  107  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 794 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 797 aa  107  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 783 aa  106  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 780 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  20.95 
 
 		 690 aa  105  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 751 aa  105  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 773 aa  104  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 792 aa  104  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 365 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 771 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 759 aa  103  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 		 737 aa  103  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>