More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2215 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 971 aa  1973    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  55.7 
 
 		 969 aa  1056    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 		 937 aa  492  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 985 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 808 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  38.74 
 
 		 722 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 896 aa  164  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  41.67 
 
 		 730 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  41.99 
 
 		 753 aa  162  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  35.98 
 
 		 734 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 796 aa  156  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  26.75 
 
 		 797 aa  155  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  38.18 
 
 		 739 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 730 aa  152  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  37.98 
 
 		 731 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 794 aa  152  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 795 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 803 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  38.37 
 
 		 763 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 903 aa  148  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 919 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  34.7 
 
 		 789 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 		 780 aa  147  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  36.8 
 
 		 747 aa  147  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 822 aa  147  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 720 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  35.98 
 
 		 817 aa  146  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  33.74 
 
 		 755 aa  146  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  38.87 
 
 		 759 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  36.78 
 
 		 807 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  34.87 
 
 		 775 aa  145  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 860 aa  145  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 755 aa  144  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  39.11 
 
 		 774 aa  144  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  36.32 
 
 		 771 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  35.18 
 
 		 763 aa  143  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 787 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  35.66 
 
 		 757 aa  143  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 746 aa  141  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 809 aa  142  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 795 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  35.97 
 
 		 700 aa  141  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 851 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  37.44 
 
 		 867 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 784 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  37.56 
 
 		 785 aa  140  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 857 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  35.61 
 
 		 744 aa  140  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3422  TonB-dependent receptor, plug  34.96 
 
 		 345 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209041  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0450  TonB-dependent receptor, plug  33.2 
 
 		 487 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144048  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 		 776 aa  139  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  36.95 
 
 		 704 aa  138  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 796 aa  137  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 737 aa  137  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 825 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  36.33 
 
 		 779 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  35.02 
 
 		 792 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 765 aa  137  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  35.48 
 
 		 808 aa  136  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 783 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 766 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 731 aa  136  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1110  Outer membrane receptor protein mostly Fe transport-like protein  36.15 
 
 		 862 aa  135  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 859 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 758 aa  135  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  42.33 
 
 		 764 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 767 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 785 aa  135  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 790 aa  135  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 780 aa  134  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  33.93 
 
 		 790 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 729 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 783 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 365 aa  134  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  36.11 
 
 		 767 aa  134  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 		 769 aa  133  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  37.6 
 
 		 853 aa  132  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  38.42 
 
 		 725 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  38.62 
 
 		 790 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 710 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 728 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  34.86 
 
 		 832 aa  132  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 778 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  36.92 
 
 		 784 aa  132  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 758 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 767 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 790 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  36.04 
 
 		 829 aa  131  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 		 751 aa  130  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 803 aa  130  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1474  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 817 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 732 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 743 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  35.22 
 
 		 862 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  32.76 
 
 		 906 aa  130  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 764 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 812 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  34.54 
 
 		 856 aa  130  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 773 aa  129  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 726 aa  129  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>