More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1633 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 906 aa  1836    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  34.94 
 
 		 903 aa  436  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 896 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 815 aa  382  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 864 aa  375  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 880 aa  355  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 862 aa  354  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 919 aa  347  8e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 838 aa  342  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 862 aa  342  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  29.47 
 
 		 839 aa  308  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 860 aa  308  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 783 aa  209  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  38.27 
 
 		 797 aa  205  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 796 aa  204  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 803 aa  202  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 808 aa  196  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 		 704 aa  194  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 786 aa  193  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 778 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 767 aa  193  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 778 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 790 aa  191  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 800 aa  189  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 800 aa  189  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 790 aa  188  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 814 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 730 aa  183  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 763 aa  182  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 761 aa  178  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 798 aa  177  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 726 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 722 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 851 aa  172  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 776 aa  171  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 780 aa  170  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 720 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 729 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2405  TonB-dependent receptor, plug  30.27 
 
 		 786 aa  169  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0816065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  32.04 
 
 		 878 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 832 aa  169  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 873 aa  168  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 755 aa  167  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 755 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  29.05 
 
 		 809 aa  165  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 815 aa  163  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 741 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 855 aa  163  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 848 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 783 aa  163  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.17 
 
 		 739 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 710 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 732 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  31.23 
 
 		 755 aa  161  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 832 aa  160  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 761 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 774 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  31.9 
 
 		 723 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 717 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 787 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 764 aa  157  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 751 aa  157  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 803 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 726 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 783 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 854 aa  154  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 730 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 822 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 835 aa  152  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 926 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 784 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 743 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 792 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 803 aa  152  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 762 aa  151  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 777 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 771 aa  150  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 797 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 774 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  34.65 
 
 		 776 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 780 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 775 aa  148  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 743 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  29.02 
 
 		 754 aa  148  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 761 aa  148  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 779 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 741 aa  147  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 796 aa  147  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 726 aa  147  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 783 aa  147  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 765 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 749 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 780 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 722 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 817 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 860 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 713 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 758 aa  144  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  30.08 
 
 		 797 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 779 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>