More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01058 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 860 aa  1764    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  49.29 
 
 		 862 aa  791    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  46.79 
 
 		 880 aa  760    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 903 aa  330  6e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  30.32 
 
 		 906 aa  308  4.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 796 aa  301  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 864 aa  299  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 896 aa  291  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 838 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 919 aa  266  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 862 aa  264  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 815 aa  263  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  28.43 
 
 		 839 aa  245  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 775 aa  230  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 808 aa  229  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 		 767 aa  220  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  28.04 
 
 		 809 aa  216  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 778 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 763 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 803 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 783 aa  204  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 835 aa  204  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 786 aa  203  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 778 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 776 aa  200  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 729 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 783 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 777 aa  195  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 780 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 797 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 720 aa  191  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 732 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 751 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 851 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 761 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 814 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 769 aa  184  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 764 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 758 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 758 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 873 aa  181  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 785 aa  181  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 797 aa  179  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.85 
 
 		 755 aa  178  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 803 aa  178  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 784 aa  178  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 759 aa  177  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 741 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 780 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2405  TonB-dependent receptor, plug  24.65 
 
 		 786 aa  176  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0816065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 855 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 771 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 817 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 790 aa  172  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 749 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 800 aa  171  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 800 aa  171  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 704 aa  171  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 764 aa  171  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 790 aa  170  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 774 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 758 aa  169  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 761 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 745 aa  168  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 848 aa  168  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 726 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 730 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 788 aa  168  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 794 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 758 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.19 
 
 		 715 aa  165  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 736 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 743 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 758 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 793 aa  164  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.96 
 
 		 776 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 775 aa  163  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 722 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  23.61 
 
 		 739 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 807 aa  161  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 803 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 771 aa  161  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 829 aa  160  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 765 aa  160  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 786 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 720 aa  158  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 746 aa  157  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 755 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 822 aa  157  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 807 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 832 aa  156  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  25.55 
 
 		 797 aa  154  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 741 aa  154  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 710 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 812 aa  153  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 854 aa  152  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 790 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 750 aa  152  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 773 aa  152  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 758 aa  150  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>