More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1913 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 862 aa  1755    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  38.28 
 
 		 919 aa  550  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 864 aa  402  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 838 aa  389  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 896 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  31.56 
 
 		 839 aa  355  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 903 aa  343  7e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  31.45 
 
 		 906 aa  342  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 815 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 862 aa  281  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 808 aa  271  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 860 aa  266  8.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 796 aa  255  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 880 aa  245  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 763 aa  233  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 855 aa  232  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 761 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 814 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 803 aa  221  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 790 aa  220  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 790 aa  220  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 773 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 783 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 851 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 800 aa  213  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 800 aa  213  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 778 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 777 aa  211  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 780 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 731 aa  204  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 873 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 798 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  34.07 
 
 		 739 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 822 aa  197  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 757 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 777 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  34.19 
 
 		 755 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 765 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  35.04 
 
 		 878 aa  191  7e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 794 aa  190  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 717 aa  190  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 764 aa  189  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 797 aa  189  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 783 aa  188  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  32.55 
 
 		 784 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 730 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  26.86 
 
 		 809 aa  187  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 758 aa  187  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 771 aa  185  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  34.7 
 
 		 741 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 795 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 775 aa  184  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 779 aa  184  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  34.67 
 
 		 755 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 769 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 755 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 848 aa  180  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 860 aa  180  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 780 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 730 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 778 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 853 aa  177  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 764 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 774 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  35.15 
 
 		 704 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 764 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 755 aa  172  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 794 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 780 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 859 aa  168  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 815 aa  168  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 759 aa  168  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 769 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 835 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 803 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 761 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 720 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 747 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 790 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 761 aa  164  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 773 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 854 aa  162  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 786 aa  162  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 780 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 776 aa  161  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 779 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 753 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 726 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 786 aa  159  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 767 aa  159  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 736 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 797 aa  158  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 784 aa  158  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 758 aa  157  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  30.77 
 
 		 767 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  24.69 
 
 		 789 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 817 aa  155  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 789 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  32.45 
 
 		 747 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 796 aa  155  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>