More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0198 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  58.93 
 
 		 855 aa  971    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  55.35 
 
 		 854 aa  904    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  54.28 
 
 		 873 aa  910    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  100 
 
 		 878 aa  1778    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  57.81 
 
 		 848 aa  964    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  59.02 
 
 		 851 aa  935    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  44.88 
 
 		 808 aa  624  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  42.64 
 
 		 814 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 835 aa  304  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 800 aa  297  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 800 aa  297  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 767 aa  288  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  31.99 
 
 		 786 aa  282  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 778 aa  280  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 790 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 790 aa  277  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 803 aa  276  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 778 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 771 aa  254  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 903 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 741 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 862 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 732 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 832 aa  216  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 720 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.72 
 
 		 755 aa  207  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 761 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 704 aa  198  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 792 aa  198  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 790 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 730 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 815 aa  194  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 790 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 765 aa  190  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 838 aa  188  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 833 aa  187  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 864 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 794 aa  185  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.74 
 
 		 715 aa  183  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 747 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 784 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 815 aa  182  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 780 aa  181  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 775 aa  180  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 769 aa  180  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 761 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 896 aa  178  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 726 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 755 aa  177  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 751 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 796 aa  176  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 794 aa  175  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 780 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 798 aa  173  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 803 aa  171  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 743 aa  171  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 777 aa  171  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2637  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 773 aa  170  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 764 aa  170  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 919 aa  169  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 771 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  32.04 
 
 		 906 aa  168  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 687 aa  168  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  26.03 
 
 		 809 aa  167  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 734 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 773 aa  166  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 773 aa  165  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 761 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 817 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 756 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 734 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 729 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  24.2 
 
 		 776 aa  163  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 786 aa  162  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 757 aa  163  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 797 aa  163  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 784 aa  162  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  24.14 
 
 		 739 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 723 aa  157  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 728 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 713 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 880 aa  155  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 741 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 725 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 763 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 788 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 858 aa  153  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 783 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 783 aa  151  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 737 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 860 aa  151  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 746 aa  150  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 745 aa  150  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 722 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 710 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 765 aa  147  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 762 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 755 aa  147  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 763 aa  146  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  25.07 
 
 		 748 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>