More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2555 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 833 aa  1712    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  45.03 
 
 		 815 aa  661    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  44.57 
 
 		 832 aa  686    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 835 aa  354  4e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 778 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 790 aa  293  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 808 aa  293  9e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 767 aa  292  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 790 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 786 aa  287  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 778 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 803 aa  275  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 814 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 800 aa  265  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 800 aa  265  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 756 aa  262  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 771 aa  260  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2637  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 773 aa  260  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 734 aa  248  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 851 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 873 aa  211  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 855 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 848 aa  209  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 854 aa  202  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 761 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  27.74 
 
 		 878 aa  179  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 720 aa  177  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 741 aa  170  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.81 
 
 		 755 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2554  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 861 aa  167  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 736 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 763 aa  162  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 880 aa  161  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 803 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 919 aa  155  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 864 aa  154  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1846  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 851 aa  153  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 783 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 783 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 790 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 903 aa  147  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 769 aa  147  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 862 aa  147  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 838 aa  146  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 749 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 862 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  28.14 
 
 		 906 aa  141  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 757 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 755 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 790 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 732 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 796 aa  138  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 780 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 815 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 797 aa  137  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 747 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 771 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 788 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 773 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 773 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 722 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 896 aa  133  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 755 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 792 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 761 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 797 aa  132  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 733 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 730 aa  131  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 704 aa  129  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 758 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 710 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 817 aa  128  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 787 aa  127  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 730 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  22.93 
 
 		 839 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 764 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 774 aa  125  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 758 aa  125  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 730 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 744 aa  125  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 798 aa  125  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 758 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 775 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 766 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 860 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 745 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 750 aa  122  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 761 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 758 aa  122  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 780 aa  120  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 794 aa  120  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 728 aa  120  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 734 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 785 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 784 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 780 aa  118  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 812 aa  118  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  22.3 
 
 		 715 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  24.1 
 
 		 759 aa  117  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 759 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>