More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1846 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1846  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 851 aa  1746    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2554  TonB-dependent receptor  49.88 
 
 		 861 aa  816    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 790 aa  226  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 790 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 778 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 835 aa  218  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 786 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 778 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 803 aa  202  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 767 aa  201  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 815 aa  194  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 832 aa  180  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 800 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 800 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 771 aa  164  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2637  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 773 aa  146  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 814 aa  144  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  25.27 
 
 		 822 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 833 aa  141  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 851 aa  140  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 848 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 808 aa  139  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 747 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  25.68 
 
 		 784 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 873 aa  127  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 756 aa  126  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 734 aa  126  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 741 aa  125  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 854 aa  124  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 773 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  25.12 
 
 		 878 aa  123  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 794 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.26 
 
 		 755 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 855 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 757 aa  115  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 749 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 785 aa  114  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 762 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 771 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 864 aa  111  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 783 aa  110  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 736 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 773 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 838 aa  108  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  23.94 
 
 		 839 aa  107  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 761 aa  107  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  22.41 
 
 		 715 aa  107  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 713 aa  105  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 896 aa  104  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 761 aa  102  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 755 aa  101  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 808 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 769 aa  99.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 862 aa  99.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 788 aa  99  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 717 aa  99  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  21.91 
 
 		 790 aa  97.8  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 783 aa  97.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 765 aa  97.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 840 aa  96.3  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 741 aa  95.9  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 790 aa  95.1  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  20.67 
 
 		 783 aa  94.7  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 690 aa  92.8  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 690 aa  93.2  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 771 aa  92.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  23.34 
 
 		 759 aa  92  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 780 aa  91.3  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 755 aa  90.9  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  21.25 
 
 		 730 aa  90.9  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  22.25 
 
 		 792 aa  89.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  22.18 
 
 		 720 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 780 aa  89.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 792 aa  88.2  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  21.24 
 
 		 734 aa  87.8  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  22.53 
 
 		 739 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 732 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 726 aa  86.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 779 aa  86.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  21.55 
 
 		 802 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 742 aa  85.1  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 776 aa  84.7  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 843 aa  84.7  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 761 aa  84.3  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 780 aa  84  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 809 aa  83.2  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 763 aa  82.4  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 751 aa  82  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 906 aa  82  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 786 aa  82  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 		 797 aa  81.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 822 aa  82  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 733 aa  81.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 880 aa  81.3  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 720 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 753 aa  80.9  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 766 aa  80.5  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  20.64 
 
 		 797 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  22.36 
 
 		 747 aa  80.1  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  21.09 
 
 		 713 aa  80.5  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>