More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2517 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  50.19 
 
 		 825 aa  768    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 809 aa  1631    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  38.22 
 
 		 780 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  29.32 
 
 		 754 aa  280  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 733 aa  269  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 763 aa  256  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  28.43 
 
 		 748 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 785 aa  249  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 734 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 803 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 730 aa  234  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 729 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 761 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 780 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 777 aa  231  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 832 aa  230  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 765 aa  230  9e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 755 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 747 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 784 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 720 aa  227  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 764 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 722 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 838 aa  224  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 790 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 790 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 786 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.82 
 
 		 739 aa  222  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 767 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 775 aa  218  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 735 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 792 aa  218  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 730 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 704 aa  217  9e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 864 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 745 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 746 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 743 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 807 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 753 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 783 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  28.55 
 
 		 747 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 771 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 732 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 804 aa  210  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 771 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 728 aa  210  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 710 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 795 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 741 aa  207  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 779 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 824 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 773 aa  205  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 794 aa  204  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 758 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 794 aa  204  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 843 aa  204  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 749 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 759 aa  203  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 725 aa  200  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 720 aa  200  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 856 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 726 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 736 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 722 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 695 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 761 aa  196  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 761 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 		 755 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 717 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 786 aa  194  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 796 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 723 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 853 aa  191  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.63 
 
 		 755 aa  190  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 755 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 756 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 762 aa  190  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 761 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 817 aa  187  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 794 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 784 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 763 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 775 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 780 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 787 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 744 aa  185  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0523  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 803 aa  185  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 724 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  26.8 
 
 		 759 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 903 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 769 aa  181  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 771 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 753 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 741 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 755 aa  181  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 764 aa  181  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 766 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 758 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 773 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>