More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0523 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0523  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 803 aa  1632    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1474  TonB-dependent receptor  37.98 
 
 		 817 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698611  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 		 854 aa  276  8e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 775 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 777 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 761 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 809 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 795 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 794 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1941  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 676 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.891675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3252  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 798 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.970825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 765 aa  180  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 817 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.51 
 
 		 739 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 790 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 746 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 730 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 792 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 761 aa  170  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 755 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 790 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 769 aa  167  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 755 aa  167  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 803 aa  161  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 758 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 784 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 773 aa  159  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 806 aa  158  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 732 aa  157  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 730 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.13 
 
 		 754 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 757 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 785 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 710 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 796 aa  150  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 832 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 764 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 764 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 782 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 729 aa  144  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 750 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 780 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 774 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 775 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 779 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 713 aa  141  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 822 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 785 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 759 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 723 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 758 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 753 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 725 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 784 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 779 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  24.65 
 
 		 759 aa  134  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 767 aa  133  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 731 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  26.4 
 
 		 763 aa  131  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 777 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 754 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 773 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  25.15 
 
 		 784 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 770 aa  129  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 773 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 803 aa  128  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 800 aa  129  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 800 aa  129  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 807 aa  128  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 825 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 702 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 855 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 732 aa  126  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  38.43 
 
 		 808 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 743 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 937 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 756 aa  124  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  33.21 
 
 		 777 aa  123  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 767 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 848 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 851 aa  121  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 761 aa  121  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 856 aa  121  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 763 aa  120  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  26.27 
 
 		 789 aa  120  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 742 aa  120  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  25.46 
 
 		 733 aa  120  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 807 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 771 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 851 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 853 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 758 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 784 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 903 aa  119  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 840 aa  118  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 835 aa  117  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 773 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 780 aa  117  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 783 aa  115  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>