More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0535 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 853 aa  1733    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  44.24 
 
 		 858 aa  645    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 804 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  32.3 
 
 		 759 aa  337  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 779 aa  335  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 771 aa  287  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 799 aa  287  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 794 aa  280  6e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  31.16 
 
 		 797 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 784 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  27.82 
 
 		 763 aa  238  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  29.74 
 
 		 807 aa  233  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 761 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 780 aa  224  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 765 aa  218  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 750 aa  217  9e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 755 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 792 aa  213  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  27.97 
 
 		 850 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 807 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 859 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.95 
 
 		 739 aa  197  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 775 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 722 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 809 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 778 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 769 aa  178  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 838 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.83 
 
 		 754 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 743 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 835 aa  174  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 862 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 778 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 780 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 797 aa  174  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 783 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 777 aa  173  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 796 aa  171  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 803 aa  165  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 761 aa  164  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 757 aa  162  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  43.17 
 
 		 784 aa  160  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 779 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 969 aa  159  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 857 aa  157  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  26.83 
 
 		 733 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 798 aa  156  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  39.06 
 
 		 766 aa  154  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  44.62 
 
 		 730 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 717 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  41.18 
 
 		 787 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 832 aa  151  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 754 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 919 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  35.41 
 
 		 744 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 		 790 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 896 aa  147  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  39 
 
 		 803 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 808 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2033  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 818 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  35.78 
 
 		 780 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 763 aa  144  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 765 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  39.38 
 
 		 726 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  43.15 
 
 		 764 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  42.72 
 
 		 817 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  35.39 
 
 		 704 aa  142  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 734 aa  142  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1941  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 676 aa  141  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.891675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 792 aa  140  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 796 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 763 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 762 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  35.14 
 
 		 755 aa  138  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 720 aa  138  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 783 aa  138  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  38.31 
 
 		 775 aa  137  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  39.36 
 
 		 736 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  38.21 
 
 		 776 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  41.05 
 
 		 729 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  41.97 
 
 		 730 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 759 aa  135  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  27.29 
 
 		 906 aa  135  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  39.22 
 
 		 867 aa  134  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 774 aa  134  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 903 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 808 aa  134  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  40.09 
 
 		 851 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1066  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 844 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308413  normal  0.134897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 790 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  39.66 
 
 		 726 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  37.6 
 
 		 971 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  35.12 
 
 		 728 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  41.45 
 
 		 860 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  36.29 
 
 		 743 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  35.43 
 
 		 751 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  36.74 
 
 		 710 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  39.9 
 
 		 809 aa  131  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  37.1 
 
 		 758 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 786 aa  131  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>