More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1489 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 859 aa  1749    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  60.85 
 
 		 867 aa  1001    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  69.66 
 
 		 860 aa  1234    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  53.94 
 
 		 851 aa  922    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 803 aa  412  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 780 aa  405  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 832 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  34.72 
 
 		 807 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 765 aa  381  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 792 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 790 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 755 aa  372  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 761 aa  352  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 856 aa  291  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 784 aa  291  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  35.17 
 
 		 780 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 794 aa  236  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 817 aa  234  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 790 aa  224  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  44.4 
 
 		 776 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 758 aa  217  9e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 756 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 759 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 779 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 791 aa  201  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 853 aa  197  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 807 aa  197  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 761 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 764 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 796 aa  185  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 758 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 741 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 704 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 749 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 848 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  49.14 
 
 		 753 aa  175  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 800 aa  171  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 800 aa  171  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 812 aa  171  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 862 aa  169  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 789 aa  167  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  40.37 
 
 		 792 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  38.02 
 
 		 775 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  26.46 
 
 		 850 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 851 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 767 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  42.71 
 
 		 743 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 736 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  39.53 
 
 		 750 aa  161  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 937 aa  160  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  36.3 
 
 		 784 aa  160  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  36.94 
 
 		 754 aa  158  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  42.92 
 
 		 728 aa  158  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  36.68 
 
 		 796 aa  158  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  40.55 
 
 		 786 aa  157  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 733 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  36.44 
 
 		 783 aa  157  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  39.72 
 
 		 774 aa  157  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  36.29 
 
 		 745 aa  157  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  40.48 
 
 		 759 aa  156  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  39.7 
 
 		 758 aa  156  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  40.1 
 
 		 758 aa  156  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  40.1 
 
 		 758 aa  156  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 729 aa  153  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  36.89 
 
 		 730 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 720 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 710 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  36.78 
 
 		 755 aa  151  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 764 aa  150  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 730 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  33.71 
 
 		 744 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  37.84 
 
 		 770 aa  149  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  33.22 
 
 		 787 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 730 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 855 aa  147  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 896 aa  147  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 783 aa  146  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  39.09 
 
 		 758 aa  147  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  37.13 
 
 		 763 aa  146  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 864 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 797 aa  144  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  41.57 
 
 		 809 aa  143  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 985 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  38.43 
 
 		 779 aa  143  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 720 aa  142  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 854 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 		 919 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  35.82 
 
 		 764 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  28.74 
 
 		 751 aa  140  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  38.81 
 
 		 804 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  35.68 
 
 		 806 aa  140  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 723 aa  140  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  33.96 
 
 		 797 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 858 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  42.25 
 
 		 771 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.42 
 
 		 739 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  35.32 
 
 		 773 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 771 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 903 aa  137  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  36.79 
 
 		 763 aa  137  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>