More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0213 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 776 aa  1571    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  40.71 
 
 		 780 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  37.21 
 
 		 803 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 765 aa  419  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 755 aa  399  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 790 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 792 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 832 aa  363  6e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 761 aa  361  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 867 aa  355  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  31.32 
 
 		 807 aa  346  8e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 851 aa  335  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 761 aa  330  6e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 780 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 790 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 792 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 783 aa  303  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 728 aa  295  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 774 aa  291  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 730 aa  286  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 704 aa  283  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 758 aa  273  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 759 aa  273  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 747 aa  269  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 753 aa  269  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 750 aa  268  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 758 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 758 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 758 aa  265  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 710 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 729 aa  265  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 758 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 722 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  29.54 
 
 		 741 aa  259  9e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 730 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 775 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  29.25 
 
 		 751 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 762 aa  249  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 780 aa  246  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 775 aa  246  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 743 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 764 aa  243  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 755 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 784 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 774 aa  238  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 856 aa  237  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 817 aa  237  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 734 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 771 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 796 aa  235  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 786 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 784 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 728 aa  231  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 723 aa  230  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 749 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  27.05 
 
 		 809 aa  229  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 741 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 777 aa  226  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 764 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 759 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 731 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 785 aa  225  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 779 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.31 
 
 		 755 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 787 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  44.4 
 
 		 859 aa  220  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 720 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 763 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 777 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 741 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.46 
 
 		 739 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 770 aa  218  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 745 aa  217  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 780 aa  216  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 726 aa  217  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 726 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  41.96 
 
 		 860 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 799 aa  212  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 773 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 771 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  28.8 
 
 		 807 aa  208  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  27.3 
 
 		 797 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 767 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 794 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 794 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 746 aa  201  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 766 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 726 aa  200  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 860 aa  200  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 815 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 761 aa  200  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 783 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 722 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 733 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 744 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 754 aa  198  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 808 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 730 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 829 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>