More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3637 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 858 aa  1748    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  43.94 
 
 		 853 aa  645    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 804 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 779 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  30.55 
 
 		 759 aa  340  9e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 784 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 799 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 771 aa  295  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  31.48 
 
 		 807 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 794 aa  282  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  30.42 
 
 		 797 aa  276  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 787 aa  270  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  30.09 
 
 		 763 aa  265  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 780 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 730 aa  237  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 726 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 765 aa  224  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.91 
 
 		 739 aa  220  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 792 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 775 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 803 aa  215  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 730 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 790 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 761 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 765 aa  201  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 780 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.25 
 
 		 755 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 763 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  25.84 
 
 		 850 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 722 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 848 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 710 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 807 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 788 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 755 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 808 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 774 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 726 aa  187  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 786 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.48 
 
 		 754 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 776 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 790 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  25.65 
 
 		 741 aa  184  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 817 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 751 aa  180  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 728 aa  178  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 756 aa  177  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 771 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 855 aa  174  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 730 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 798 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 777 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 729 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 754 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 803 aa  164  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 814 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 783 aa  164  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 725 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  26.36 
 
 		 784 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 769 aa  162  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 873 aa  160  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 782 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  25.63 
 
 		 751 aa  157  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 838 aa  157  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 755 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 717 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 790 aa  154  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 797 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 779 aa  153  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 770 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 862 aa  151  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 780 aa  150  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 786 aa  150  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 851 aa  150  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 790 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 880 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 773 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 796 aa  148  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 778 aa  148  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 896 aa  146  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 758 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 778 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 731 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 854 aa  145  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  37.61 
 
 		 859 aa  144  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 772 aa  144  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25 
 
 		 755 aa  144  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 741 aa  144  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 784 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  23.11 
 
 		 809 aa  143  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 777 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  40.28 
 
 		 860 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 734 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 730 aa  142  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 790 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 758 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  38.39 
 
 		 851 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 695 aa  137  7.000000000000001e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 761 aa  137  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 812 aa  137  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>