More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4804 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 773 aa  1584    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  55.72 
 
 		 767 aa  830    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  35.9 
 
 		 730 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 743 aa  355  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 764 aa  325  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 779 aa  324  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 782 aa  323  6e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  32.1 
 
 		 733 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 774 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 771 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 763 aa  296  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 755 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 756 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 789 aa  274  5.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 759 aa  269  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 803 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 758 aa  261  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 761 aa  258  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 746 aa  257  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 765 aa  255  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 737 aa  254  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 764 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 772 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 764 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 725 aa  241  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 780 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 780 aa  240  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 751 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 726 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 741 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 777 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.08 
 
 		 739 aa  236  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 744 aa  237  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 790 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 766 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  27.54 
 
 		 789 aa  235  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 748 aa  231  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 758 aa  231  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 755 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 704 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 761 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 729 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 710 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 728 aa  224  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 722 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 783 aa  224  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 862 aa  223  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 749 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 776 aa  223  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 726 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 754 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 724 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 730 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 785 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 743 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 747 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 794 aa  217  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 776 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 763 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 807 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 730 aa  213  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 757 aa  213  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 771 aa  213  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 792 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 722 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 758 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 745 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 720 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 822 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 763 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 733 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 761 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 832 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 773 aa  201  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  27.67 
 
 		 738 aa  201  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 743 aa  200  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 786 aa  200  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 795 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  29.62 
 
 		 759 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 808 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 804 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 809 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 753 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 783 aa  197  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 764 aa  197  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 762 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 780 aa  196  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 775 aa  196  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 769 aa  195  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 780 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 732 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 769 aa  193  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 784 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 731 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 771 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 755 aa  192  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 713 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 774 aa  190  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 777 aa  190  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 778 aa  190  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>