More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0981 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 807 aa  1639    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  40.49 
 
 		 761 aa  567  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  37.55 
 
 		 803 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  38.65 
 
 		 755 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  37.78 
 
 		 790 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  37.91 
 
 		 780 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 		 792 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  36.97 
 
 		 832 aa  437  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  35.43 
 
 		 765 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  34.61 
 
 		 790 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  35.12 
 
 		 780 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 851 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 859 aa  408  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 860 aa  402  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 761 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 776 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 753 aa  325  3e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 728 aa  295  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  33.56 
 
 		 743 aa  294  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 783 aa  292  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 775 aa  283  9e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 804 aa  283  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 732 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 856 aa  276  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 784 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 796 aa  271  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 720 aa  267  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 730 aa  264  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 763 aa  261  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 780 aa  255  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 794 aa  255  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  28.48 
 
 		 751 aa  252  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 758 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 758 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 758 aa  248  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 729 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 743 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 771 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 755 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 867 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  27.76 
 
 		 741 aa  239  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 771 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 758 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 785 aa  237  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 779 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 759 aa  235  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.77 
 
 		 754 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 774 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 758 aa  232  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 773 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 756 aa  230  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 764 aa  229  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 751 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 720 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 853 aa  225  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 770 aa  224  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  29.13 
 
 		 733 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 730 aa  222  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 809 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 777 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 767 aa  217  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.66 
 
 		 739 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 817 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 767 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 759 aa  214  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 726 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 799 aa  212  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 792 aa  212  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 735 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 763 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 800 aa  209  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 800 aa  209  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  25.51 
 
 		 809 aa  209  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 783 aa  208  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 806 aa  207  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 858 aa  206  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 789 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 803 aa  205  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 764 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 733 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 790 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 780 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 725 aa  200  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 771 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 851 aa  198  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 744 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 857 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 774 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  26.81 
 
 		 797 aa  196  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 753 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 758 aa  193  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 848 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 783 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 777 aa  191  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 780 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 793 aa  190  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 795 aa  191  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 753 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  27.47 
 
 		 763 aa  189  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 764 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>