More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0680 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  62.31 
 
 		 802 aa  933    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 753 aa  1514    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  42.12 
 
 		 771 aa  538  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 847 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  33.59 
 
 		 822 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 734 aa  312  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 763 aa  311  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 742 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  31.94 
 
 		 784 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 757 aa  300  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 762 aa  297  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 777 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 807 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 777 aa  283  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 752 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 786 aa  277  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 747 aa  277  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 795 aa  275  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 766 aa  274  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 712 aa  273  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  30.47 
 
 		 785 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 795 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 791 aa  263  8.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 808 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 875 aa  258  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 781 aa  257  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 780 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 808 aa  254  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 780 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 806 aa  250  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  29.27 
 
 		 889 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 798 aa  241  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 792 aa  240  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  29.59 
 
 		 856 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 724 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 795 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 704 aa  229  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 804 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 788 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 803 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 761 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 747 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 720 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 777 aa  211  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 753 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 763 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 904 aa  200  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 710 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 853 aa  197  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 713 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 797 aa  196  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 775 aa  196  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 802 aa  196  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 749 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 		 759 aa  194  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 743 aa  194  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 851 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 723 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 722 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 783 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 790 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 767 aa  191  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 764 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.67 
 
 		 776 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 757 aa  190  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 736 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.09 
 
 		 715 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 732 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 803 aa  186  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 755 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 713 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 763 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 795 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 808 aa  183  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 771 aa  183  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.47 
 
 		 739 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 702 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 730 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 773 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 784 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 730 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 732 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 809 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 796 aa  181  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 807 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 761 aa  180  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 737 aa  180  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 765 aa  180  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 771 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 786 aa  178  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 687 aa  178  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 780 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 773 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 809 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  27 
 
 		 846 aa  177  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 784 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 734 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 790 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 728 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 778 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>