More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1656 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 764 aa  1556    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  46.93 
 
 		 785 aa  645    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  42.32 
 
 		 767 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  44.43 
 
 		 779 aa  608  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  44.43 
 
 		 790 aa  602  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  40.15 
 
 		 773 aa  537  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  39.56 
 
 		 809 aa  532  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  40.48 
 
 		 795 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  40.33 
 
 		 784 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 822 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 810 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 777 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 771 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1443  TonB-dependent receptor  34.59 
 
 		 863 aa  268  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 730 aa  260  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 704 aa  259  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 763 aa  258  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 756 aa  257  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.64 
 
 		 739 aa  257  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 732 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 769 aa  249  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 734 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 710 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 755 aa  246  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 758 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 720 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 759 aa  236  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 723 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 773 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 743 aa  231  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 741 aa  227  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 730 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 725 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 737 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 802 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 766 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 749 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 743 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 758 aa  217  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 767 aa  217  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 751 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 763 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 857 aa  212  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 728 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  26.89 
 
 		 797 aa  210  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 726 aa  210  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 761 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 744 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 780 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 753 aa  207  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 761 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 759 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 747 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 735 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 729 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 757 aa  205  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 856 aa  205  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  27.36 
 
 		 809 aa  204  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 792 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 790 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 753 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 695 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 817 aa  201  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 736 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 784 aa  200  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  26.72 
 
 		 784 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 790 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 761 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 775 aa  197  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 783 aa  196  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 713 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 743 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 731 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 771 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 864 aa  195  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 807 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 784 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 762 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 825 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 780 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 782 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 803 aa  193  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 764 aa  193  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 733 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 838 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 731 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 769 aa  192  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 780 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 774 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 753 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 777 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 724 aa  190  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 779 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 785 aa  188  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 758 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 732 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  25.8 
 
 		 822 aa  188  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 794 aa  187  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 853 aa  187  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 832 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>