More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0924 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  49.94 
 
 		 809 aa  730    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 795 aa  1615    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  42.35 
 
 		 767 aa  579  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  40.48 
 
 		 764 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  39.05 
 
 		 773 aa  517  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  39.15 
 
 		 779 aa  505  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  39.49 
 
 		 785 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  38.04 
 
 		 790 aa  478  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 		 784 aa  475  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1443  TonB-dependent receptor  37.28 
 
 		 863 aa  446  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161464 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 822 aa  401  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 810 aa  332  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 777 aa  332  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 743 aa  296  7e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 737 aa  257  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 771 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 756 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 758 aa  232  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 730 aa  230  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 769 aa  229  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 755 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 720 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 764 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 746 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 723 aa  221  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 748 aa  220  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 732 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 704 aa  212  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 743 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 766 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 741 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 763 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 783 aa  203  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 743 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 710 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 730 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.73 
 
 		 739 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  29.86 
 
 		 733 aa  200  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 779 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 785 aa  197  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  28.2 
 
 		 789 aa  197  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 751 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 773 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 764 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 724 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  26.14 
 
 		 822 aa  193  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 780 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 767 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 725 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 759 aa  190  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 732 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  27.1 
 
 		 784 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 761 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 757 aa  188  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 782 aa  187  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 758 aa  187  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 728 aa  187  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 763 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 747 aa  184  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 753 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 761 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 792 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 803 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 803 aa  181  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 857 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 734 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 784 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 802 aa  177  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 775 aa  177  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1977  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 741 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 		 767 aa  176  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 790 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 722 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 755 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 726 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 792 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 763 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  26.45 
 
 		 747 aa  172  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 687 aa  171  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 790 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  25.69 
 
 		 829 aa  171  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 808 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 730 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 854 aa  170  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 729 aa  170  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 731 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 774 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  25.85 
 
 		 809 aa  169  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 761 aa  168  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 731 aa  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.44 
 
 		 755 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 713 aa  167  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 722 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 867 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 757 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 755 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 736 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 744 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 753 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 860 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>