More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5045 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 726 aa  1461    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  44.94 
 
 		 730 aa  551  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  41.54 
 
 		 722 aa  497  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  43.47 
 
 		 726 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  38.18 
 
 		 722 aa  435  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  34.45 
 
 		 771 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 717 aa  312  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 763 aa  311  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 730 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 726 aa  295  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 710 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 736 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 704 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 779 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 741 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 759 aa  274  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 732 aa  274  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 725 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 720 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  31.9 
 
 		 739 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 755 aa  264  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 728 aa  263  6.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 817 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 784 aa  257  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 771 aa  257  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 734 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 784 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 700 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 769 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 790 aa  253  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 723 aa  253  9.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 758 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 785 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 761 aa  250  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 747 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 804 aa  248  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 743 aa  247  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 769 aa  246  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  30.35 
 
 		 695 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 758 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 838 aa  244  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 743 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 749 aa  241  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 783 aa  239  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 796 aa  239  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 767 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 782 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 780 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 792 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 822 aa  237  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 787 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 745 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 773 aa  234  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 794 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 786 aa  233  9e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 761 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 794 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 758 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 864 aa  231  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 780 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 779 aa  230  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 758 aa  230  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 765 aa  230  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 729 aa  230  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 755 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.03 
 
 		 754 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 766 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 756 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 762 aa  228  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 777 aa  228  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 789 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 771 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 733 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 755 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 758 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 786 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 919 aa  225  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 744 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 702 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 764 aa  223  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 764 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 728 aa  222  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 746 aa  221  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 780 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 738 aa  221  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 731 aa  220  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 730 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 788 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 771 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 773 aa  219  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 773 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 753 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 731 aa  217  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 808 aa  217  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 794 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 851 aa  217  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 776 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 789 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 735 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 790 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>