More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2075 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 759 aa  1545    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  57.64 
 
 		 771 aa  842    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  40.43 
 
 		 804 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  38.12 
 
 		 779 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 853 aa  336  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 858 aa  327  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 780 aa  303  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  30.81 
 
 		 797 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 799 aa  289  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  31.03 
 
 		 807 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  31.3 
 
 		 763 aa  285  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 784 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 790 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 784 aa  271  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 761 aa  266  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 787 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 730 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 761 aa  258  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 755 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 743 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 794 aa  254  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 780 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 730 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 765 aa  243  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 745 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 704 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 749 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 780 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 792 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 817 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 741 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 764 aa  231  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 765 aa  230  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 732 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 775 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 790 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 710 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 736 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 758 aa  221  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.57 
 
 		 739 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 726 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 720 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 758 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 758 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 729 aa  217  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  29.34 
 
 		 850 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  30.95 
 
 		 741 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 758 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 755 aa  215  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 856 aa  215  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 728 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 747 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 728 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 786 aa  209  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  29.61 
 
 		 751 aa  209  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 775 aa  207  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 825 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.14 
 
 		 754 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 783 aa  205  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 766 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 773 aa  204  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 758 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 773 aa  203  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 771 aa  203  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 769 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 726 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 750 aa  202  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 695 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 777 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 759 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 700 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 771 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 788 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 731 aa  197  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 796 aa  194  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 746 aa  194  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 731 aa  194  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 759 aa  193  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 734 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 783 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 773 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 751 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 737 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 743 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 794 aa  185  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 772 aa  185  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 783 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 783 aa  184  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 754 aa  183  9.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 763 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 770 aa  182  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 723 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 769 aa  180  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.3 
 
 		 715 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 809 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 758 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 774 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 713 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 822 aa  178  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>