More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0549 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  53.94 
 
 		 815 aa  850    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  45.7 
 
 		 833 aa  665    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 832 aa  1721    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 835 aa  385  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 808 aa  332  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 790 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 790 aa  317  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 767 aa  312  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 786 aa  302  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 778 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 803 aa  298  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 778 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 814 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 800 aa  281  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 800 aa  281  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 771 aa  278  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 848 aa  244  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2637  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 773 aa  229  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 851 aa  228  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 854 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 873 aa  221  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 855 aa  221  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 761 aa  213  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 756 aa  208  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  27.27 
 
 		 878 aa  208  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.69 
 
 		 755 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 741 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 720 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 734 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 838 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 797 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2554  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 861 aa  183  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 862 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1846  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 851 aa  179  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 736 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 796 aa  174  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 864 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 880 aa  170  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 780 aa  168  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 763 aa  167  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 773 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 771 aa  164  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 741 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 856 aa  161  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 783 aa  161  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 797 aa  160  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 798 aa  160  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 732 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 704 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  30.53 
 
 		 906 aa  160  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 903 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 860 aa  156  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 730 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 777 aa  155  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 773 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 779 aa  154  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 780 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 783 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 764 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 759 aa  151  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 815 aa  151  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 790 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 775 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 803 aa  148  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 730 aa  148  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 780 aa  148  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 761 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 896 aa  147  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 749 aa  147  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 747 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 792 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 722 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 775 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  23.02 
 
 		 839 aa  145  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 726 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 755 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 785 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  23.85 
 
 		 715 aa  142  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 757 aa  142  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 783 aa  141  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 726 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 790 aa  142  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 695 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 862 aa  139  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 771 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  23.06 
 
 		 739 aa  138  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 734 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 710 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 824 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 728 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 765 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  24.82 
 
 		 784 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 919 aa  132  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 794 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 788 aa  132  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 687 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 779 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 733 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 732 aa  127  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 763 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>