More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2919 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 763 aa  1566    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  46.01 
 
 		 741 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  45.39 
 
 		 755 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  42.01 
 
 		 761 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 797 aa  365  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 798 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  33.11 
 
 		 797 aa  343  5e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 783 aa  340  7e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 786 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 790 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 790 aa  247  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 778 aa  240  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  30.45 
 
 		 767 aa  237  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 803 aa  235  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 778 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 755 aa  230  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 757 aa  226  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 800 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 800 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 835 aa  196  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 848 aa  194  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.71 
 
 		 739 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 747 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 785 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 788 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 808 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 769 aa  187  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 780 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 771 aa  185  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 761 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 730 aa  185  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 780 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 704 aa  182  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 741 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.74 
 
 		 754 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 710 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 734 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 794 aa  179  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 726 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 720 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 775 aa  175  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 749 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 832 aa  174  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 730 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 713 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 815 aa  171  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 728 aa  171  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 873 aa  170  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 		 695 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 790 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 730 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 759 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 814 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 851 aa  168  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 733 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 817 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 777 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 792 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 763 aa  164  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 776 aa  164  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 786 aa  163  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 724 aa  163  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 790 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 751 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 761 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 731 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 833 aa  161  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 755 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 745 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  24.2 
 
 		 776 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1889  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 817 aa  160  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 756 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 736 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 763 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 771 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 783 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 756 aa  158  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 784 aa  158  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 765 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 722 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 771 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 734 aa  157  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 855 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 743 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 758 aa  157  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 732 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 783 aa  155  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 758 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 780 aa  155  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 776 aa  154  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 764 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 838 aa  154  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 732 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 753 aa  153  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  23.82 
 
 		 748 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 720 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  27.33 
 
 		 878 aa  152  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 722 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 775 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 803 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>