More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4008 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 365 aa  731    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  67.24 
 
 		 766 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  35.88 
 
 		 712 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 752 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 780 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 763 aa  159  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  34.37 
 
 		 780 aa  159  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  33.9 
 
 		 822 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  34.68 
 
 		 784 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  34.83 
 
 		 771 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 734 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 802 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 795 aa  153  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  35.41 
 
 		 889 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  32.97 
 
 		 785 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  37 
 
 		 781 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  38.31 
 
 		 791 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  36.27 
 
 		 753 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 806 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 742 aa  142  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 786 aa  142  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  41.2 
 
 		 764 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  35.77 
 
 		 723 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 795 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 971 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 802 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 737 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 797 aa  136  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 875 aa  135  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  32.94 
 
 		 856 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 829 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 747 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 808 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 969 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 777 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 757 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 713 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  38.65 
 
 		 775 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 729 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  31.29 
 
 		 801 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 783 aa  122  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 		 926 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 756 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 755 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 847 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 792 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 785 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 720 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2405  TonB-dependent receptor, plug  30 
 
 		 786 aa  120  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0816065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 883 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 862 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 860 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 937 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 771 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 743 aa  116  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 777 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 800 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 800 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 743 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 880 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  36.53 
 
 		 700 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 		 777 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 761 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 		 795 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 903 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0346  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 836 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 807 aa  113  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 985 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 764 aa  112  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 798 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  31.48 
 
 		 755 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 859 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 780 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  36.73 
 
 		 846 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 785 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 807 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  34.87 
 
 		 704 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 762 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 886 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 778 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 746 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 806 aa  109  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 904 aa  109  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 896 aa  109  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 860 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 725 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 731 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 755 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 786 aa  107  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 761 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 797 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 731 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 769 aa  106  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 783 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  32.11 
 
 		 776 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 730 aa  106  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 780 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 851 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1106  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 829 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 856 aa  105  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>