More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3422 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3422  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 345 aa  691    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209041  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  40 
 
 		 739 aa  206  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  39.18 
 
 		 710 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  38.56 
 
 		 730 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 		 758 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 789 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 769 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 749 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 		 736 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  37.55 
 
 		 807 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  37.65 
 
 		 969 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 704 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  35.9 
 
 		 903 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 937 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  35.39 
 
 		 741 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  35.6 
 
 		 786 aa  149  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  43.19 
 
 		 783 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 743 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  38.22 
 
 		 726 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 730 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 758 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 775 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 985 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 803 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0450  TonB-dependent receptor, plug  40.58 
 
 		 487 aa  142  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144048  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  40.29 
 
 		 766 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 971 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  36.32 
 
 		 723 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  39.2 
 
 		 747 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  37.55 
 
 		 744 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 745 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  37.71 
 
 		 755 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  35.83 
 
 		 728 aa  139  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 779 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 		 771 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  41.74 
 
 		 794 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 722 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 734 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 896 aa  136  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  38.69 
 
 		 730 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 725 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 873 aa  135  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 		 779 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  35.59 
 
 		 851 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 746 aa  133  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 759 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  37.61 
 
 		 848 aa  132  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  36.99 
 
 		 763 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 777 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  38.89 
 
 		 814 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  35.43 
 
 		 862 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  36.89 
 
 		 771 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  35.25 
 
 		 700 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  36.8 
 
 		 776 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  39.39 
 
 		 758 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  36.87 
 
 		 759 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 765 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  32.67 
 
 		 755 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 		 755 aa  129  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 732 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 817 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  43.87 
 
 		 771 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 713 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 780 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 750 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 769 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  30.93 
 
 		 774 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 770 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 741 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  34.4 
 
 		 761 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 796 aa  127  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 775 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 751 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 860 aa  126  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 765 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 720 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 		 808 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 855 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  35.21 
 
 		 726 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 780 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 776 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  38.98 
 
 		 733 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 761 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 774 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 722 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 756 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 880 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 802 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 763 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 730 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 784 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  31.19 
 
 		 773 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  34.08 
 
 		 854 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  34.12 
 
 		 779 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 728 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 761 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  34.53 
 
 		 763 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 778 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 853 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 851 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>