More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1050 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 830 aa  1679    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  42.35 
 
 		 798 aa  632  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  43.22 
 
 		 788 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  34.55 
 
 		 808 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 802 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 763 aa  213  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 771 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 795 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 777 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 807 aa  181  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 757 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 781 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 786 aa  172  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 791 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 792 aa  171  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 780 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 747 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 780 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 762 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 795 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 802 aa  164  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  26.17 
 
 		 846 aa  163  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  24.68 
 
 		 785 aa  163  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  25.18 
 
 		 822 aa  160  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 808 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 806 aa  157  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  24.82 
 
 		 784 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 712 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 742 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 732 aa  151  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 766 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  24.38 
 
 		 889 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 875 aa  149  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.4 
 
 		 715 aa  147  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 751 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 797 aa  143  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 729 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 734 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 764 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 795 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 847 aa  138  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 723 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 753 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 753 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 777 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 731 aa  134  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 732 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  21.95 
 
 		 703 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  24.29 
 
 		 797 aa  131  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  25.63 
 
 		 751 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.37 
 
 		 739 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  24.05 
 
 		 856 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 763 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 783 aa  126  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 803 aa  125  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 773 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 722 aa  124  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 771 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 734 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 770 aa  121  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 904 aa  120  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 757 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 775 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 780 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 748 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 785 aa  119  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 790 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  21.09 
 
 		 690 aa  118  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 809 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  23.91 
 
 		 829 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 752 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 771 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 745 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 704 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 743 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 777 aa  115  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  22.53 
 
 		 809 aa  115  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 743 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 735 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 722 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 785 aa  115  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 787 aa  114  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 744 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 737 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.95 
 
 		 755 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 777 aa  112  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 757 aa  112  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  23 
 
 		 797 aa  112  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 809 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 789 aa  111  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 744 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 773 aa  111  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  21.63 
 
 		 690 aa  110  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 726 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 746 aa  109  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 695 aa  109  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 687 aa  109  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 738 aa  109  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 765 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2711  TonB-dependent receptor, plug  22.42 
 
 		 762 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.882237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>