More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2484 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  73.29 
 
 		 736 aa  1107    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  89.88 
 
 		 733 aa  1313    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  97.85 
 
 		 743 aa  1497    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  68.74 
 
 		 730 aa  1042    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 744 aa  1532    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  98.52 
 
 		 743 aa  1508    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  70.57 
 
 		 729 aa  1085    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  64.58 
 
 		 744 aa  958    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  73.57 
 
 		 713 aa  1104    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  90.95 
 
 		 729 aa  1321    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  90.98 
 
 		 732 aa  1375    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  78.1 
 
 		 748 aa  1198    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  74.04 
 
 		 733 aa  1129    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  98.25 
 
 		 744 aa  1508    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  77.34 
 
 		 757 aa  1196    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  73.44 
 
 		 712 aa  1091    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  41.2 
 
 		 697 aa  509  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  39.19 
 
 		 726 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 		 687 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  33.42 
 
 		 714 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02805  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 696 aa  333  7.000000000000001e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00354555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 853 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 851 aa  228  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 690 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 690 aa  201  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 720 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 695 aa  183  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.28 
 
 		 715 aa  180  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 729 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 687 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 713 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 728 aa  175  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 720 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 783 aa  170  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 732 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 755 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 773 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 763 aa  165  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 761 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 747 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 704 aa  162  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 		 767 aa  162  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 765 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 794 aa  158  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 734 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 764 aa  157  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 771 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.22 
 
 		 759 aa  154  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 753 aa  154  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 712 aa  153  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 803 aa  153  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 773 aa  151  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 641 aa  150  6e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 710 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 762 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 702 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 700 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 737 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 695 aa  146  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 732 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 686 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.03 
 
 		 755 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 763 aa  144  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 731 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 753 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 749 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 775 aa  141  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 743 aa  140  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 769 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 741 aa  140  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 761 aa  138  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  23.64 
 
 		 776 aa  138  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 723 aa  137  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 795 aa  137  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 724 aa  137  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 783 aa  136  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 778 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  23.92 
 
 		 751 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 790 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 694 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 746 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 726 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 792 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 790 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 733 aa  133  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 799 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 670 aa  133  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  24.34 
 
 		 692 aa  133  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 769 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 764 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 771 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 761 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 741 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  22.69 
 
 		 802 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 666 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  23.83 
 
 		 784 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 761 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 764 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 764 aa  131  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 778 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>