More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2726 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 829 aa  1646    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  41.13 
 
 		 804 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  35.08 
 
 		 756 aa  333  6e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  33.62 
 
 		 801 aa  320  7e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1810  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 770 aa  302  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1106  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 829 aa  281  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 763 aa  203  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 766 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 771 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 753 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 847 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 747 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 795 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 807 aa  160  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 802 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 712 aa  159  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 757 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  26.01 
 
 		 785 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 777 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 742 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 792 aa  157  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 808 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  25.7 
 
 		 856 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 724 aa  147  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  25.87 
 
 		 822 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 795 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 798 aa  144  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 762 aa  141  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 808 aa  139  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  24.37 
 
 		 784 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 786 aa  138  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 365 aa  135  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 777 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 795 aa  134  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 806 aa  133  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 734 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 730 aa  124  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 780 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 883 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 794 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 764 aa  121  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 835 aa  120  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 720 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  23.71 
 
 		 830 aa  119  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 666 aa  119  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 755 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 780 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 752 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  23.8 
 
 		 889 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 731 aa  118  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 687 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 702 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 704 aa  114  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 775 aa  114  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 722 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 875 aa  112  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 802 aa  111  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 755 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 729 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 690 aa  108  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 670 aa  107  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 751 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 797 aa  106  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 853 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 732 aa  105  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 690 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 728 aa  104  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 722 aa  104  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 		 695 aa  103  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 729 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 755 aa  103  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 728 aa  103  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 729 aa  102  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 710 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 764 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 737 aa  101  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.72 
 
 		 685 aa  101  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 851 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 736 aa  100  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 749 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 753 aa  100  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 737 aa  99.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 773 aa  100  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 757 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 767 aa  98.2  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 766 aa  98.2  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 744 aa  97.8  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 733 aa  97.1  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.8 
 
 		 755 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 713 aa  97.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 712 aa  97.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 791 aa  97.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  23.05 
 
 		 739 aa  97.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 748 aa  96.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 784 aa  95.5  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 747 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 700 aa  95.1  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 773 aa  93.6  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 803 aa  93.6  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 763 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>