More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0393 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 670 aa  1377    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  45.35 
 
 		 666 aa  570  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 749 aa  200  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 687 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 853 aa  191  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 690 aa  190  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 851 aa  186  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 690 aa  183  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 695 aa  181  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 736 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 680 aa  170  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 720 aa  170  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 717 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 741 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.93 
 
 		 715 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 710 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 729 aa  162  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 747 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 722 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 761 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 728 aa  160  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 726 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 713 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  26.39 
 
 		 691 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 732 aa  153  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 704 aa  153  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 695 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 713 aa  150  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  26.24 
 
 		 673 aa  150  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 712 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 783 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.55 
 
 		 685 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 700 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 724 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  24.25 
 
 		 759 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 694 aa  146  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 720 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 732 aa  144  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  24.84 
 
 		 739 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 720 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.03 
 
 		 754 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 726 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 641 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 693 aa  141  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 796 aa  140  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 746 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 764 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 737 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 733 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 713 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 751 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 729 aa  137  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 743 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 758 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 744 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 732 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 743 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 794 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 702 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 730 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 686 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 730 aa  134  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 758 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 789 aa  133  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 755 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 784 aa  133  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 736 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 697 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 662 aa  133  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 743 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  24.12 
 
 		 759 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 764 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 733 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 776 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 757 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 734 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 769 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 748 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 763 aa  131  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 758 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 741 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 774 aa  130  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 790 aa  130  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 761 aa  130  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 758 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 733 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 765 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 744 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 753 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 758 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 726 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 755 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 758 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 734 aa  127  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 761 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 766 aa  127  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 669 aa  127  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 780 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 903 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  23.05 
 
 		 729 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>