More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1810 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1810  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 770 aa  1523    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  46.23 
 
 		 801 aa  614  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1106  TonB-dependent receptor  41.84 
 
 		 829 aa  544  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  34.59 
 
 		 804 aa  362  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 		 756 aa  321  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 829 aa  301  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 752 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 763 aa  160  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 712 aa  158  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  27.5 
 
 		 856 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 795 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 734 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 847 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 771 aa  148  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 802 aa  143  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 784 aa  140  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 795 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 786 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 753 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  24.49 
 
 		 822 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 777 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 791 aa  126  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 808 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  24.55 
 
 		 785 aa  125  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 747 aa  124  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  24.93 
 
 		 889 aa  124  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 762 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 757 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 797 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 802 aa  112  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 806 aa  111  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 724 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 766 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 904 aa  105  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 720 aa  104  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 732 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 777 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 792 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 808 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 851 aa  99.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 780 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 687 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 775 aa  99  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  36.84 
 
 		 875 aa  99  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 795 aa  99  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 853 aa  98.2  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  34.91 
 
 		 886 aa  97.8  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 742 aa  97.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 883 aa  95.9  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 732 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  22.54 
 
 		 781 aa  94  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 690 aa  92.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 780 aa  91.3  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 695 aa  90.9  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 690 aa  90.9  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 704 aa  90.1  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 846 aa  89.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  24.71 
 
 		 673 aa  88.2  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 753 aa  87.4  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 771 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 725 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 926 aa  86.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 720 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  26.42 
 
 		 830 aa  84.3  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 669 aa  81.6  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 812 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 840 aa  80.1  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 737 aa  79.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 730 aa  77.8  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 697 aa  77.4  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  22.05 
 
 		 715 aa  75.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 775 aa  75.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 769 aa  75.5  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 828 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  30.94 
 
 		 829 aa  75.1  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 800 aa  75.1  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 800 aa  75.1  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 747 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  21.75 
 
 		 774 aa  74.7  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.04 
 
 		 739 aa  74.3  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 755 aa  74.3  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  34.39 
 
 		 755 aa  73.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 737 aa  72.4  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 746 aa  72.4  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 792 aa  72  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0838  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 671 aa  71.6  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 709 aa  71.6  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 788 aa  71.6  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 		 729 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 743 aa  71.2  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 731 aa  70.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  33.51 
 
 		 798 aa  70.9  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 728 aa  70.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 778 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 755 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 764 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 758 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 771 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  30.14 
 
 		 776 aa  69.7  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>