More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0714 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  90.51 
 
 		 780 aa  1462    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  46.08 
 
 		 791 aa  653    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  84.76 
 
 		 781 aa  1366    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 780 aa  1596    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  42.61 
 
 		 889 aa  567  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  33.59 
 
 		 785 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 807 aa  316  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 757 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 802 aa  277  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 762 aa  270  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  30.63 
 
 		 784 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 753 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 747 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 795 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 786 aa  248  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 771 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  29.26 
 
 		 822 aa  238  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 763 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 766 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 734 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 752 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 802 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 797 aa  213  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 806 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 712 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 795 aa  204  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 795 aa  203  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 792 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 808 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 904 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 788 aa  197  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 798 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  27.76 
 
 		 856 aa  190  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 777 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 753 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 847 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 808 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 777 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 763 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 724 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 742 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 875 aa  177  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 702 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 704 aa  173  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.27 
 
 		 695 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 853 aa  169  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 851 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 720 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 792 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 758 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  25.53 
 
 		 830 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 761 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 790 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 703 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 794 aa  156  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 726 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 790 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.99 
 
 		 739 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 		 365 aa  154  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  27.16 
 
 		 748 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 763 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 771 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 710 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 774 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 769 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 733 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 730 aa  148  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 769 aa  147  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 695 aa  146  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 720 aa  146  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 780 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.47 
 
 		 715 aa  145  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 795 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 732 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 713 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 746 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 767 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 723 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 804 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 775 aa  143  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 709 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 757 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  22.4 
 
 		 690 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 796 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 729 aa  142  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 747 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.89 
 
 		 776 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 784 aa  141  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 700 aa  140  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 764 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 725 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 756 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 785 aa  139  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 690 aa  138  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 666 aa  137  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 764 aa  137  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  24.05 
 
 		 846 aa  137  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 732 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 780 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 803 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>