More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1053 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  46.05 
 
 		 889 aa  650    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 791 aa  1606    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  46.08 
 
 		 780 aa  653    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  45.89 
 
 		 780 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  46.71 
 
 		 781 aa  652    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  32.17 
 
 		 785 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 757 aa  304  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 762 aa  302  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 807 aa  298  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 786 aa  273  7e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  30.96 
 
 		 784 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 795 aa  270  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 753 aa  263  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  29.74 
 
 		 822 aa  259  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 802 aa  256  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 763 aa  247  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 747 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 806 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 752 aa  240  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 766 aa  231  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 734 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 808 aa  224  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  27.47 
 
 		 856 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 795 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 771 aa  218  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 795 aa  217  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 802 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 808 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 712 aa  210  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 720 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 792 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 797 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 777 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 798 aa  194  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 904 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 753 aa  189  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 777 aa  188  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 790 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 875 aa  185  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 704 aa  183  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 742 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 700 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 788 aa  178  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 792 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 724 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 766 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 847 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 767 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  27.22 
 
 		 830 aa  169  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 702 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 763 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 695 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 775 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 777 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 733 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 783 aa  164  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 710 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 736 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  25.82 
 
 		 846 aa  159  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 751 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  24.52 
 
 		 804 aa  157  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 774 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 784 aa  153  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 790 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 765 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 853 aa  151  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 773 aa  151  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 759 aa  150  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 779 aa  150  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 790 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 761 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 795 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 851 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 741 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 747 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 725 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  39.47 
 
 		 365 aa  146  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 713 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 731 aa  146  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 723 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 763 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 769 aa  145  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 764 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 732 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 780 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 757 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 749 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 709 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 886 aa  141  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 746 aa  140  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 778 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 779 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 755 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 730 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 788 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 883 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 726 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  26.26 
 
 		 776 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 728 aa  137  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 794 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>