More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4197 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 702 aa  1419    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  38.99 
 
 		 695 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 		 713 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 767 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  36.25 
 
 		 700 aa  372  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 732 aa  342  9e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 733 aa  312  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 718 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 713 aa  303  8.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 685 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 737 aa  266  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 751 aa  257  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  30.17 
 
 		 715 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 703 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2033  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 818 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 775 aa  234  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 853 aa  232  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 851 aa  228  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 726 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 704 aa  223  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0178  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 841 aa  221  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 737 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 802 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 723 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 747 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 764 aa  213  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 743 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 730 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 724 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 766 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 777 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 712 aa  207  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 730 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 794 aa  206  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 730 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1066  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 844 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308413  normal  0.134897 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 763 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 771 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 757 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 720 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 761 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 758 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 731 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 759 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 732 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 710 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 782 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  26.63 
 
 		 748 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 779 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 730 aa  197  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 743 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 734 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  28.63 
 
 		 733 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 753 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 731 aa  194  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 757 aa  194  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 803 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 722 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 792 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 755 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 784 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 744 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 761 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 749 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 795 aa  184  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 688 aa  184  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 773 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 774 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 753 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 771 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 773 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 785 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 903 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  27.57 
 
 		 784 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 794 aa  181  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 736 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 787 aa  180  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 764 aa  180  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 795 aa  180  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 720 aa  180  9e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 771 aa  180  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 790 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 695 aa  179  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 761 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 783 aa  177  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 780 aa  176  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 783 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 771 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 774 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 808 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.33 
 
 		 739 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 717 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 720 aa  175  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.15 
 
 		 754 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 786 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 690 aa  174  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 746 aa  174  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 690 aa  173  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 726 aa  173  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 722 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>