More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2580 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  61.07 
 
 		 795 aa  950    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 806 aa  1628    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  62.58 
 
 		 786 aa  962    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  52.02 
 
 		 802 aa  786    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  53.98 
 
 		 797 aa  792    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 763 aa  335  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 747 aa  292  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 807 aa  288  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 757 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  30.73 
 
 		 785 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 802 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 753 aa  250  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 791 aa  242  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 771 aa  241  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  31.16 
 
 		 822 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 762 aa  228  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  30 
 
 		 784 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 734 aa  222  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 795 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  28.89 
 
 		 889 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 795 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 808 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 780 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 780 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 742 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 781 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  28.7 
 
 		 856 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 777 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 792 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 904 aa  191  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 875 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 712 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 777 aa  183  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 713 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 720 aa  181  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 804 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 766 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 763 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 737 aa  177  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 700 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 798 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 751 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 788 aa  167  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 743 aa  162  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 752 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  25.3 
 
 		 830 aa  158  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 795 aa  157  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 704 aa  157  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 808 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 883 aa  153  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 730 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 847 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 753 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 732 aa  147  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 702 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 808 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 822 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 724 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 794 aa  144  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 774 aa  144  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 794 aa  144  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 780 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 783 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 757 aa  142  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 756 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 731 aa  140  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 726 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 786 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 365 aa  139  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 747 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  26.07 
 
 		 747 aa  138  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 777 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 803 aa  136  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 739 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 764 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 765 aa  135  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 783 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 784 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 734 aa  134  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 763 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 903 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 729 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 775 aa  131  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 695 aa  131  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 730 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 741 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 788 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 829 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 786 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 762 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 767 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 743 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 755 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 733 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 784 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 775 aa  129  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.91 
 
 		 767 aa  129  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 710 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 764 aa  128  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 730 aa  127  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>