More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0838 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0838  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 671 aa  1368    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 680 aa  294  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.93 
 
 		 685 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  31.38 
 
 		 691 aa  263  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  29.66 
 
 		 673 aa  245  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 662 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 669 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 722 aa  206  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 694 aa  150  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.58 
 
 		 715 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 755 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 690 aa  137  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 693 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 666 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 690 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 732 aa  124  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 711 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 713 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 724 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 710 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 670 aa  115  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 687 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 751 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 747 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 692 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 702 aa  107  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 712 aa  105  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 746 aa  104  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 720 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 694 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 713 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  24.69 
 
 		 822 aa  102  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 736 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 761 aa  99.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.2 
 
 		 755 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 777 aa  100  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 695 aa  99  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 730 aa  97.1  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 700 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 713 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 720 aa  96.3  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 771 aa  95.9  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 684 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 732 aa  94.4  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 686 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 745 aa  94  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 853 aa  93.6  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 685 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 851 aa  91.7  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 694 aa  91.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 703 aa  91.3  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 704 aa  90.9  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  22.71 
 
 		 695 aa  90.9  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 750 aa  90.5  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 748 aa  89  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  23.72 
 
 		 694 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 794 aa  88.6  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 719 aa  88.6  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 694 aa  88.2  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 734 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  24.1 
 
 		 784 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  22.8 
 
 		 767 aa  87  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 731 aa  85.9  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3147  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 711 aa  85.5  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.116125  hitchhiker  0.00000946048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  22.97 
 
 		 809 aa  85.5  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 775 aa  84.7  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 795 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  42.75 
 
 		 771 aa  84.3  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  21.78 
 
 		 729 aa  84  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 743 aa  84  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4852  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 772 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3472  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 705 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.280502  normal  0.0143409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 803 aa  83.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 786 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3345  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 705 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 712 aa  82.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  24.79 
 
 		 739 aa  82  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0231  TonB-dependent siderophore receptor  24.36 
 
 		 771 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3671  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 705 aa  82  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 754 aa  82  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 737 aa  81.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  36.9 
 
 		 766 aa  81.6  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 802 aa  81.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 789 aa  81.3  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0343  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 686 aa  81.3  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.926534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 730 aa  81.3  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 770 aa  81.3  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  37.84 
 
 		 829 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 758 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 758 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 758 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 764 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  37.31 
 
 		 759 aa  79.7  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 733 aa  79.7  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 697 aa  79  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 762 aa  79  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 728 aa  78.2  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 757 aa  78.2  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 851 aa  77.8  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 780 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>