More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3147 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  65.32 
 
 		 694 aa  966    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  49.77 
 
 		 692 aa  665    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  54.14 
 
 		 719 aa  746    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  65.26 
 
 		 711 aa  935    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  65.13 
 
 		 694 aa  934    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3147  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 711 aa  1462    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.116125  hitchhiker  0.00000946048 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  54.49 
 
 		 694 aa  742    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  72.13 
 
 		 694 aa  1047    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3472  TonB-dependent receptor  38.74 
 
 		 705 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.280502  normal  0.0143409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3671  TonB-dependent receptor  38.6 
 
 		 705 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3345  TonB-dependent receptor  38.74 
 
 		 705 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0977  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 		 707 aa  325  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.138127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1803  ferric vibriobactin receptor  28.91 
 
 		 687 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0343  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 686 aa  240  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.926534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 712 aa  228  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3727  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 685 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0330  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 685 aa  221  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4516  ferric vibriobactin receptor  30 
 
 		 685 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3798  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 685 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 686 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3923  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 685 aa  207  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3484  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 685 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2167  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 685 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00521843  hitchhiker  0.00163603 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0621  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 686 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119281  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 835 aa  165  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 741 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 695 aa  142  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 720 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 700 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 713 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 641 aa  135  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  27.84 
 
 		 691 aa  134  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 853 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 851 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 761 aa  123  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.28 
 
 		 695 aa  124  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 736 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 690 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 690 aa  123  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 710 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 697 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 713 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 726 aa  119  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 687 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 728 aa  117  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 736 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 763 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.88 
 
 		 715 aa  114  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 773 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.81 
 
 		 685 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 738 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  23.29 
 
 		 729 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 761 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 771 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 743 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 735 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 741 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 731 aa  111  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  22.66 
 
 		 776 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 757 aa  111  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 730 aa  111  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 794 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 666 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 753 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 848 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 731 aa  110  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 730 aa  109  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 713 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 712 aa  109  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 773 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 808 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 775 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 743 aa  108  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 730 aa  107  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 720 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 733 aa  107  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 732 aa  106  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 717 aa  104  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 763 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  24.78 
 
 		 747 aa  103  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 733 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 685 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 873 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 680 aa  102  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 764 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 703 aa  101  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 758 aa  101  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 712 aa  100  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 757 aa  100  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 765 aa  100  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 748 aa  100  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  24.59 
 
 		 755 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 784 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 761 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 729 aa  99.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 749 aa  99.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 759 aa  99  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  24.97 
 
 		 759 aa  98.2  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 729 aa  98.2  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 776 aa  97.8  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>