More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0880 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 680 aa  1385    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  42.19 
 
 		 722 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  35.13 
 
 		 691 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.18 
 
 		 685 aa  326  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 662 aa  296  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0838  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 671 aa  294  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  30.35 
 
 		 669 aa  267  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  30.05 
 
 		 673 aa  256  9e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.33 
 
 		 715 aa  213  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 713 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 724 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 687 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 695 aa  182  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 755 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.67 
 
 		 755 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 720 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 853 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 851 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 733 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 736 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 713 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 741 aa  170  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 670 aa  170  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 700 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 710 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 751 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 688 aa  164  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 710 aa  163  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 704 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 752 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 748 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 775 aa  160  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 761 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 730 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 743 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 773 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  24.21 
 
 		 695 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 720 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 757 aa  157  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 702 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 778 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 790 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 719 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 803 aa  154  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 767 aa  154  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 790 aa  154  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 666 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 763 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 690 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 778 aa  151  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 737 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 749 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 732 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 763 aa  150  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 713 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 722 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 730 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 755 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 817 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 747 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 762 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 764 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 766 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 786 aa  143  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 734 aa  144  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 690 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 785 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 730 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 732 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 731 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 797 aa  142  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 761 aa  141  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 763 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 753 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 729 aa  140  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1499  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 649 aa  138  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.378064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 726 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 743 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 726 aa  137  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 685 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 684 aa  137  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 713 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  26.37 
 
 		 733 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 728 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 723 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  26.25 
 
 		 856 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 693 aa  135  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 741 aa  135  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 759 aa  135  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 738 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 787 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 761 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 744 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 753 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 784 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 711 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 809 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 712 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 783 aa  132  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 773 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>