More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1495 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 662 aa  1334    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  33.1 
 
 		 691 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 722 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 680 aa  296  6e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0838  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 671 aa  239  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.99 
 
 		 685 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  29.52 
 
 		 673 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 669 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 732 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 761 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.12 
 
 		 715 aa  161  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 720 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 700 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 787 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  23.75 
 
 		 695 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 853 aa  152  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 765 aa  151  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 713 aa  151  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 851 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 704 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 726 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 759 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 764 aa  136  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.13 
 
 		 755 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 688 aa  136  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 693 aa  136  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 690 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 733 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 670 aa  133  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 757 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 690 aa  131  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 722 aa  130  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 730 aa  130  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 741 aa  128  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 713 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 722 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 769 aa  127  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 751 aa  127  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 694 aa  126  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 712 aa  126  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 720 aa  125  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 741 aa  122  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 794 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  26.51 
 
 		 856 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 755 aa  120  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 788 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 684 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 741 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 790 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 666 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 766 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 761 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 703 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 778 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 728 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 710 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 738 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 790 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 731 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 754 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 797 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 732 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 687 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 783 aa  111  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 777 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 724 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  23.32 
 
 		 748 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 755 aa  110  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 803 aa  110  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  26.5 
 
 		 733 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 767 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 778 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 717 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 759 aa  109  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 734 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 758 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 730 aa  108  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 774 aa  108  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 758 aa  107  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 777 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 758 aa  106  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 710 aa  105  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 775 aa  105  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 729 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 747 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 802 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  26.25 
 
 		 822 aa  104  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 803 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 795 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 758 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 		 767 aa  103  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 786 aa  103  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 769 aa  103  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 720 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 737 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  24.73 
 
 		 889 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 731 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 641 aa  102  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 730 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>