More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1427 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 713 aa  1432    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 684 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 688 aa  251  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1499  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 649 aa  224  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.378064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 741 aa  223  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 710 aa  211  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 724 aa  200  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54950  hypothetical protein  33.33 
 
 		 448 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000000000000722946  unclonable  3.2012599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 853 aa  196  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 851 aa  193  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 695 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.17 
 
 		 715 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 747 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 690 aa  173  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 680 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 755 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 732 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 761 aa  171  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 713 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 704 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.95 
 
 		 755 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 767 aa  167  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 794 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 741 aa  163  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 697 aa  162  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 690 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  27.99 
 
 		 691 aa  160  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 766 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 753 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 695 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 722 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 702 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.22 
 
 		 685 aa  157  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 749 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 734 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 773 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 666 aa  154  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 765 aa  154  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 759 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 730 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 712 aa  152  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 762 aa  152  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 662 aa  151  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 720 aa  151  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 670 aa  150  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 710 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 700 aa  150  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 763 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 779 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 778 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 730 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 722 aa  147  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 732 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 795 aa  145  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 713 aa  145  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 731 aa  145  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 687 aa  144  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 778 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 771 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 732 aa  141  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 694 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  24.85 
 
 		 729 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 783 aa  140  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 767 aa  140  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 722 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 761 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 712 aa  139  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 751 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 743 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 764 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 755 aa  137  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 737 aa  137  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 755 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 789 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 731 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  25.75 
 
 		 673 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 777 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 746 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 803 aa  135  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 725 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 712 aa  134  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 797 aa  134  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 742 aa  134  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 726 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 763 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 733 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 744 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 748 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 757 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 743 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 803 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 723 aa  131  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 744 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 733 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  24.36 
 
 		 669 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 752 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 720 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 773 aa  128  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  26.34 
 
 		 733 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 744 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>