More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54950 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_54950  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  909    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000000000000722946  unclonable  3.2012599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 713 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 684 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 688 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1499  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 649 aa  153  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.378064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 741 aa  152  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 724 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 762 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 690 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 690 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 726 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 765 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 710 aa  103  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 753 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 757 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.98 
 
 		 715 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 761 aa  99.8  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 687 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 751 aa  97.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 695 aa  96.7  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 755 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 759 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 713 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 		 753 aa  93.6  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.93 
 
 		 685 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 731 aa  93.2  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 697 aa  92.8  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 851 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 853 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 734 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 730 aa  91.3  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 748 aa  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 757 aa  89.7  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 726 aa  89.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 779 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 733 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 764 aa  87.8  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 670 aa  87.4  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 704 aa  87.8  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 712 aa  87  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 703 aa  86.7  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 777 aa  86.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 765 aa  86.3  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 853 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 741 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 773 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 769 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 722 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 767 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.24 
 
 		 755 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 763 aa  85.5  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 732 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 732 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  29.34 
 
 		 785 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 733 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 730 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 784 aa  85.1  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 743 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 710 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 731 aa  84  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 747 aa  83.6  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  25.71 
 
 		 822 aa  84  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 788 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 732 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 728 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 762 aa  83.6  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 761 aa  83.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 761 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  28.84 
 
 		 691 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 666 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 720 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 802 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 736 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 700 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0330  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 685 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 730 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 759 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 728 aa  80.9  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 758 aa  80.5  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 729 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 783 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 800 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 800 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 763 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 771 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 771 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 741 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 859 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 807 aa  79.7  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 730 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  25.19 
 
 		 829 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3727  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 685 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 753 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 680 aa  79  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 777 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 767 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 763 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 729 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 744 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3484  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 685 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>