More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0330 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4516  ferric vibriobactin receptor  82.48 
 
 		 685 aa  1170    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2167  TonB-dependent receptor  82.77 
 
 		 685 aa  1159    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00521843  hitchhiker  0.00163603 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3484  TonB-dependent receptor  82.63 
 
 		 685 aa  1157    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0621  TonB-dependent receptor  66.62 
 
 		 686 aa  972    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119281  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0330  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 685 aa  1384    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3727  TonB-dependent receptor  83.07 
 
 		 685 aa  1197    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3798  TonB-dependent receptor  83.21 
 
 		 685 aa  1172    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3923  TonB-dependent receptor  83.65 
 
 		 685 aa  1177    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0343  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 		 686 aa  297  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.926534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1803  ferric vibriobactin receptor  30.2 
 
 		 687 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0977  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 707 aa  256  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.138127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 		 692 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 694 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 711 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  29.07 
 
 		 694 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3147  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 711 aa  231  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.116125  hitchhiker  0.00000946048 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 694 aa  229  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 719 aa  226  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3345  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 705 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 712 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3472  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 705 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.280502  normal  0.0143409 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 694 aa  219  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3671  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 705 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 835 aa  180  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 686 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 695 aa  146  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 700 aa  140  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 690 aa  137  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 713 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 690 aa  134  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 737 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 697 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 779 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 728 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 764 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 747 aa  124  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 853 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 726 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 794 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 702 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 851 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 713 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 720 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 730 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 767 aa  118  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 733 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 710 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 732 aa  114  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 732 aa  114  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  23.58 
 
 		 729 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 687 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 641 aa  110  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 753 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 687 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 703 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 695 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 712 aa  109  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  34.58 
 
 		 776 aa  108  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 736 aa  107  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0231  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 771 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 670 aa  105  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 749 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  23.66 
 
 		 739 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 780 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  23.44 
 
 		 715 aa  102  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 		 798 aa  101  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 763 aa  101  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 728 aa  101  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 694 aa  100  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 685 aa  100  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.81 
 
 		 666 aa  100  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 710 aa  99.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 743 aa  99.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 759 aa  100  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 729 aa  99  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 758 aa  99  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 757 aa  98.2  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  23.75 
 
 		 714 aa  97.4  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 722 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 763 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 773 aa  96.3  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 713 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  22.54 
 
 		 748 aa  95.9  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 786 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 730 aa  94.4  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 790 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 896 aa  92.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 766 aa  93.2  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  27.58 
 
 		 906 aa  92.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 790 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 738 aa  91.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 688 aa  91.7  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 734 aa  91.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2161  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 729 aa  91.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 815 aa  90.9  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 		 730 aa  90.9  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 736 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 790 aa  89.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 746 aa  89  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 742 aa  88.2  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>