More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10200 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  54.14 
 
 		 719 aa  748    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  64.86 
 
 		 711 aa  939    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  71.04 
 
 		 694 aa  1025    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  100 
 
 		 694 aa  1423    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  67.48 
 
 		 694 aa  1002    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  50.08 
 
 		 692 aa  668    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  53.03 
 
 		 694 aa  747    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3147  TonB-dependent receptor  72.13 
 
 		 711 aa  1047    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.116125  hitchhiker  0.00000946048 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3345  TonB-dependent receptor  37.63 
 
 		 705 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3671  TonB-dependent receptor  37.77 
 
 		 705 aa  505  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3472  TonB-dependent receptor  37.48 
 
 		 705 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.280502  normal  0.0143409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0977  TonB-dependent siderophore receptor  35.08 
 
 		 707 aa  346  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.138127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1803  ferric vibriobactin receptor  28.33 
 
 		 687 aa  273  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0343  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 686 aa  261  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.926534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 712 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0621  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 686 aa  233  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 686 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0330  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 685 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3727  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 685 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3798  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 685 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3484  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 685 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2167  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 685 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00521843  hitchhiker  0.00163603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4516  ferric vibriobactin receptor  28.22 
 
 		 685 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3923  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 685 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 835 aa  183  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 695 aa  152  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 794 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 713 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  28.38 
 
 		 691 aa  140  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 695 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 704 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 774 aa  137  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 710 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 690 aa  135  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 853 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 851 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 720 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 713 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 690 aa  133  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 747 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 703 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 775 aa  131  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 728 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 687 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 761 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 736 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  22.97 
 
 		 776 aa  127  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 764 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 741 aa  127  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 736 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 753 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.38 
 
 		 715 aa  125  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 729 aa  125  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 712 aa  124  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 730 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 641 aa  122  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 762 aa  120  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 713 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 688 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 732 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 729 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 697 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 733 aa  117  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 763 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 728 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 680 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 720 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 730 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  24.77 
 
 		 748 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 771 aa  114  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 737 aa  114  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 784 aa  114  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 759 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 741 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 743 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 738 aa  112  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 733 aa  110  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 744 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 780 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 753 aa  109  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 685 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 744 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 743 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 730 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 764 aa  108  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 744 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 666 aa  107  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 758 aa  107  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 808 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 744 aa  106  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 745 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 755 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 732 aa  106  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 735 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 759 aa  104  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 763 aa  104  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 753 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 786 aa  103  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 733 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 737 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>