More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0977 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0977  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 707 aa  1461    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.138127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1803  ferric vibriobactin receptor  42.98 
 
 		 687 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 694 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  35.08 
 
 		 694 aa  346  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  34.85 
 
 		 719 aa  343  9e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  35.05 
 
 		 711 aa  340  8e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  34.18 
 
 		 692 aa  335  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3147  TonB-dependent receptor  34.34 
 
 		 711 aa  325  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.116125  hitchhiker  0.00000946048 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  33.13 
 
 		 694 aa  318  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 694 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3345  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 705 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3671  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 705 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3472  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 705 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.280502  normal  0.0143409 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0621  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 686 aa  272  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119281  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3484  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 685 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2167  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 685 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00521843  hitchhiker  0.00163603 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3727  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 685 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4516  ferric vibriobactin receptor  31.78 
 
 		 685 aa  250  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0330  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 685 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3798  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 685 aa  241  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3923  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 685 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 712 aa  217  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0343  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 686 aa  213  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.926534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 835 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 686 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 700 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 710 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 732 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 733 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 767 aa  120  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 729 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 713 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 748 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 757 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 720 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 794 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 728 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 736 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 758 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 712 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 713 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 775 aa  107  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 736 aa  107  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 747 aa  103  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 783 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 761 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 766 aa  100  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 741 aa  99.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 720 aa  97.8  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 728 aa  97.4  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 753 aa  97.1  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 722 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 704 aa  97.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 680 aa  95.5  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 737 aa  94.7  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 702 aa  94  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 732 aa  94  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 695 aa  92.4  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 749 aa  91.3  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  21.96 
 
 		 687 aa  91.3  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 662 aa  88.6  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  20.16 
 
 		 641 aa  88.2  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 802 aa  87.8  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 733 aa  87  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  30.69 
 
 		 695 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 795 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  22.56 
 
 		 739 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 745 aa  86.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 775 aa  85.5  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 726 aa  85.9  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 729 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  27.49 
 
 		 714 aa  85.1  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 687 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 734 aa  84.3  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 758 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2161  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 729 aa  83.2  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 730 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 738 aa  83.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 792 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 723 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 779 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 743 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 744 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 759 aa  81.6  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 718 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.78 
 
 		 685 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 786 aa  81.3  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 743 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1400  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 678 aa  80.1  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 744 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  21.57 
 
 		 703 aa  79  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 694 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3419  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 985 aa  77.8  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 693 aa  77.8  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 697 aa  77  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 763 aa  76.6  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 729 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 794 aa  75.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 722 aa  75.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>