More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3345 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3472  TonB-dependent receptor  99.72 
 
 		 705 aa  1442    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.280502  normal  0.0143409 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3345  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 705 aa  1446    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3671  TonB-dependent receptor  98.72 
 
 		 705 aa  1432    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  41.47 
 
 		 719 aa  555  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  41.18 
 
 		 711 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  41.12 
 
 		 692 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  38.75 
 
 		 694 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  37.63 
 
 		 694 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  39.73 
 
 		 694 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 694 aa  492  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3147  TonB-dependent receptor  38.74 
 
 		 711 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.116125  hitchhiker  0.00000946048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0977  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 		 707 aa  291  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.138127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 712 aa  249  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1803  ferric vibriobactin receptor  27.48 
 
 		 687 aa  240  5.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 686 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3727  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 685 aa  234  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0621  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 686 aa  226  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119281  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3798  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 685 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4516  ferric vibriobactin receptor  29.97 
 
 		 685 aa  217  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3923  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 685 aa  216  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2167  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 685 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00521843  hitchhiker  0.00163603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0330  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 685 aa  210  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3484  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 685 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0343  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 686 aa  201  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.926534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 835 aa  185  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 720 aa  146  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 688 aa  135  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 732 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 690 aa  124  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 761 aa  122  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 737 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 690 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 728 aa  117  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 712 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 697 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  23.68 
 
 		 715 aa  115  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 695 aa  115  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 729 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  23.03 
 
 		 776 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 776 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 748 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  23.2 
 
 		 729 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 733 aa  114  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 851 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 757 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 758 aa  112  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 853 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 764 aa  111  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 730 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 743 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 703 aa  107  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 713 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 761 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 713 aa  104  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 733 aa  105  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 743 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 680 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 741 aa  103  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 710 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  23.98 
 
 		 695 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 687 aa  101  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 750 aa  100  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 780 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 728 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 763 aa  99.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 722 aa  99  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 792 aa  98.6  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 755 aa  98.2  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 717 aa  97.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 641 aa  95.9  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 734 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 733 aa  95.9  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 790 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 684 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 802 aa  94.7  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 758 aa  94.7  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.57 
 
 		 685 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 743 aa  94.4  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 790 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 729 aa  94  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 724 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  23.37 
 
 		 714 aa  94  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 741 aa  93.2  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 726 aa  92.8  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 693 aa  92.8  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 763 aa  92.8  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 700 aa  93.2  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 758 aa  92.8  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 786 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  21.93 
 
 		 769 aa  91.7  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 758 aa  91.7  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 736 aa  90.9  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  24.1 
 
 		 691 aa  90.9  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 758 aa  90.5  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 761 aa  89.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 713 aa  89.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 718 aa  89.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1499  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 649 aa  89  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.378064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 731 aa  89  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 687 aa  89  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>