More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2695 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  63.7 
 
 		 694 aa  903    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3147  TonB-dependent receptor  65.26 
 
 		 711 aa  935    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.116125  hitchhiker  0.00000946048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  54.35 
 
 		 719 aa  749    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 711 aa  1458    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  55.49 
 
 		 694 aa  764    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  48.18 
 
 		 692 aa  652    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  64.86 
 
 		 694 aa  939    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  70.2 
 
 		 694 aa  1035    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3345  TonB-dependent receptor  41.18 
 
 		 705 aa  532  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3472  TonB-dependent receptor  41.04 
 
 		 705 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.280502  normal  0.0143409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3671  TonB-dependent receptor  41.18 
 
 		 705 aa  529  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0977  TonB-dependent siderophore receptor  35.05 
 
 		 707 aa  340  8e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.138127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1803  ferric vibriobactin receptor  29.06 
 
 		 687 aa  282  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 712 aa  276  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0343  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 686 aa  264  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.926534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 686 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0621  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 686 aa  233  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119281  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0330  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 685 aa  228  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3727  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 685 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3798  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 685 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3484  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 685 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4516  ferric vibriobactin receptor  29.17 
 
 		 685 aa  213  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2167  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 685 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00521843  hitchhiker  0.00163603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3923  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 685 aa  211  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 835 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 697 aa  160  9e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 851 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.44 
 
 		 715 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 853 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 695 aa  153  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  28.34 
 
 		 691 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 713 aa  147  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 732 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 713 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 690 aa  141  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 741 aa  138  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 728 aa  137  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 747 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 690 aa  136  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 736 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 729 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 680 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 710 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 712 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 743 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 730 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 695 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 687 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 733 aa  128  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 720 aa  129  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  25.17 
 
 		 729 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 757 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 744 aa  127  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 748 aa  127  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 726 aa  127  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 744 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 743 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 755 aa  125  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 641 aa  124  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 733 aa  124  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 700 aa  124  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 744 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0838  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 671 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 666 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  22.93 
 
 		 776 aa  120  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 763 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 758 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 753 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 728 aa  117  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 794 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 712 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 776 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  23.67 
 
 		 759 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 737 aa  114  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 730 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 685 aa  110  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 764 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 713 aa  109  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 722 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 736 aa  107  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 738 aa  107  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  21.95 
 
 		 783 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 735 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  23.75 
 
 		 785 aa  105  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 724 aa  105  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.35 
 
 		 685 aa  104  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 771 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 771 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 732 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 688 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 702 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 775 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 774 aa  101  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 773 aa  101  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 758 aa  101  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 758 aa  100  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 669 aa  100  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 737 aa  99.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 758 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>